Majisuka Gakuen é um colégio de yankees onde a porrada come solta e a única regra existente é: apenas a mais forte pode chegar ao topo. A barulhenta Onizuka Daruma e a silenciosa Maeda Atsuko são alunas novas e logo de começo já vão ter que mostrar sua seriedade e encarar o Team Hormone para tentar provar se podem ou não sobreviver na escola.
Chega o dia da formatura em Majisuka e também o dia de tristes despedidas, mas enquanto as mais velhas se despedem do colégio, a nova geração começa a se preparar para entrar em ação.
Após conseguir o respeito das alunas de Majisuka, Maeda finalmente se encontra pronta para subir as escadarias que levam à sala do Rappappa, para finalmente enfrentar uma das últimas barreiras que à separam do topo: a vice-presidente Sado.
Sem a proteção do Rappappa, Majisuka está enfraquecido e Nezumi se aproveita disso para ajudar a escola rival Yabakune a derrotar Maeda e dominar o colégio, mas Maeda terá uma inesperada aliada.
Com a derrota de todas as outras rainhas, Sado não vê outra alternativa a não ser despertar o poder de Torigoya que estava adormecido, mas essa decisão pode custar caro. Enquanto isso, o plano de Nezumi se aproxima da sua conclusão.
Maeda precisa encarar o seu maior desafio até o momento quando a psicopata Gekikara, outra das rainhas do Rappappa, sai da prisão onde estava. Ao contrário das outras alunas, Gekikara não se importa com a vitória, apenas com violência e em causar dor.
Após a derrota de Shibuya, quem cruza o caminho é a misteriosa rainha Black, que dizem torturar seus adversários antes de matá-los. Dessa vez Maeda pode não chegar a tempo para salvar Daruma, mas ela conta com o apoio de novas aliadas.
Shibuya, uma das quatro rainhas do Rappappa, está incomodada com as vitórias de Maeda dentro de Majisuka, mas ainda obedece as ordens de Sado, a vice-presidente que proibiu todas de brigarem. Nezumi tenta fazer com que elas briguem de qualquer forma mas antes Shibuya terá que acertar contas do passado com Daruma.
As coisas se complicam em Majisuka com a chegada de Choukoku, que planeja derrotar 100 adversários e em sua contagem faltam apenas 7. Ela encontra a misteriosa Nezumi, que a incita a incluir Maeda na sua contagem de 100 pessoas, mas Nezumi tem seus próprios motivos para querer que Maeda seja derrotada...
